Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UFM1P61960 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
UFM1P61960 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
UFM1P61960 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms