Protein–RNA interactions for Protein: P60983

GMFB, Glia maturation factor beta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMFBP60983 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMFBP60983 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GMFBP60983 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
GMFBP60983 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
GMFBP60983 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
GMFBP60983 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMFBP60983 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMFBP60983 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMFBP60983 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMFBP60983 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMFBP60983 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMFBP60983 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMFBP60983 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMFBP60983 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
GMFBP60983 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms