Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NLRP6P59044 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NLRP6P59044 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms