Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
LINC01547P58512 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms