Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CASP7P55210 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CASP7P55210 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CASP7P55210 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CASP7P55210 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP7P55210 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP7P55210 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP7P55210 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CASP7P55210 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CASP7P55210 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms