Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CACNB3P54284 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CACNB3P54284 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms