Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GTF2A1P52655 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms