Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DAP3P51398 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DAP3P51398 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DAP3P51398 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DAP3P51398 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
DAP3P51398 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DAP3P51398 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DAP3P51398 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms