Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV1P50549 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV1P50549 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV1P50549 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV1P50549 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV1P50549 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV1P50549 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV1P50549 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ETV1P50549 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ETV1P50549 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ETV1P50549 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms