Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TAF6P49848 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TAF6P49848 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TAF6P49848 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TAF6P49848 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF6P49848 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF6P49848 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF6P49848 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF6P49848 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF6P49848 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TAF6P49848 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms