Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GSK3BP49841 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GSK3BP49841 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms