Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CLK1P49759 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CLK1P49759 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CLK1P49759 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms