Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
LHX1P48742 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX1P48742 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX1P48742 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX1P48742 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX1P48742 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX1P48742 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.66
LHX1P48742 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
LHX1P48742 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
LHX1P48742 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
LHX1P48742 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms