Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PITPNBP48739 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms