Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGER2P43116 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms