Protein–RNA interactions for Protein: P40926

MDH2, Malate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH2P40926 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MDH2P40926 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MDH2P40926 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MDH2P40926 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms