Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GJC1P36383 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GJC1P36383 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GJC1P36383 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GJC1P36383 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GJC1P36383 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
GJC1P36383 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms