Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CCKBRP32239 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms