Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HOXA13P31271 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXA13P31271 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms