Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GABRB3P28472 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms