Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ABCD3P28288 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms