Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HLA-DMAP28067 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
HLA-DMAP28067 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms