Protein–RNA interactions for Protein: P22303

ACHE, Acetylcholinesterase, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACHEP22303 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACHEP22303 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ACHEP22303 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ACHEP22303 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACHEP22303 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms