Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ATF1P18846 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ATF1P18846 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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