Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
ITGB6P18564 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ITGB6P18564 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms