Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GM2AP17900 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GM2AP17900 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GM2AP17900 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GM2AP17900 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GM2AP17900 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms