Protein–RNA interactions for Protein: P16452

EPB42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB42P16452 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
EPB42P16452 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
EPB42P16452 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
EPB42P16452 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPB42P16452 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPB42P16452 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPB42P16452 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPB42P16452 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPB42P16452 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
EPB42P16452 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms