Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSPP15924 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSPP15924 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DSPP15924 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSPP15924 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSPP15924 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSPP15924 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSPP15924 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DSPP15924 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DSPP15924 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DSPP15924 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSPP15924 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DSPP15924 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSPP15924 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSPP15924 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSPP15924 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSPP15924 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSPP15924 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSPP15924 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSPP15924 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DSPP15924 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms