Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
GABRA1P14867 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms