Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
HLA-DOBP13765 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HLA-DOBP13765 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms