Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ITGAMP11215 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ITGAMP11215 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms