Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ZNF888P0CJ79 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ZNF888P0CJ79 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms