Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MMP10P09238 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MMP10P09238 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP10P09238 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP10P09238 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP10P09238 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP10P09238 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP10P09238 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MMP10P09238 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MMP10P09238 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MMP10P09238 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP10P09238 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP10P09238 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP10P09238 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP10P09238 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP10P09238 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP10P09238 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP10P09238 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MMP10P09238 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms