Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PTPRCP08575 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PTPRCP08575 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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