Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CSF1RP07333 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CSF1RP07333 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms