Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CENPBP07199 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPBP07199 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPBP07199 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPBP07199 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPBP07199 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPBP07199 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPBP07199 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CENPBP07199 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CENPBP07199 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CENPBP07199 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CENPBP07199 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms