Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
APOA4P06727 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
APOA4P06727 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
APOA4P06727 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
APOA4P06727 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms