Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTMAP06454 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTMAP06454 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms