Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SYF2O95926 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYF2O95926 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SYF2O95926 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms