Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
C6orf47O95873 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C6orf47O95873 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms