Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
POP4O95707 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
POP4O95707 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
POP4O95707 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
POP4O95707 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms