Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATG13O75143 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATG13O75143 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG13O75143 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG13O75143 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG13O75143 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG13O75143 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG13O75143 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG13O75143 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG13O75143 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG13O75143 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATG13O75143 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATG13O75143 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms