Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KIAA0556O60303 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KIAA0556O60303 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms