Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TMPRSS11DO60235 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TMPRSS11DO60235 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms