Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SSNA1O43805 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SSNA1O43805 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms