Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SOCS1O15524 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms