Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
VILLO15195 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
VILLO15195 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VILLO15195 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VILLO15195 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms