Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CTDSP2O14595 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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