Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
POLRMTO00411 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms