Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBXN8O00124 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms